يُباشر معاون العميد للشؤون العلمية مهامه من خلال التنسيق المباشر مع عميد الكلية ورؤساء الأقسام العلمية، ويعتمد في عمله على تنظيم وتوجيه العملية التعليمية والبحثية بشكل يضمن الالتزام بالسياسات العلمية التي تضعها وزارة التعليم العالي والبحث العلمي.

تتضمن الآلية متابعة تنفيذ الخطط الدراسية، والإشراف على برامج الدراسات العليا، ومراقبة جودة التعليم داخل القاعات والمختبرات. كما يعمل على إدارة شؤون البحوث والأنشطة العلمية، بما في ذلك النشر الأكاديمي وتنظيم المؤتمرات والندوات، وتطوير الأداء التدريسي من خلال الدورات العلمية والتطوير المهني.

يتابع المعاون العلمي حركة الترقيات العلمية لأعضاء الهيئة التدريسية، ويتعاون مع الوحدات ذات العلاقة مثل وحدة البحث والتطوير، وشعبة ضمان الجودة، ووحدة التعليم المستمر، لضمان تحقيق الأهداف التعليمية والبحثية للكلية.

كما يعتمد على استخدام التقنيات الحديثة في إدارة العملية العلمية، ويشجع على الانفتاح الأكاديمي والتعاون مع المؤسسات التعليمية الأخرى داخل وخارج العراق، بما يعزز من مكانة الكلية أكاديمياً وعلمياً.